El municipio de San Sebastián Río Hondo cuenta con una extensión territorial de 81.65 km², a una altitud media de 2,420 m.s.n.m. Colinda con los municipios de
Miahuatlán de Porfirio Díaz,
San Andrés Paxtlán,
San Pedro Mixtepec (Distrito 26),
San Mateo Río Hondo,
Santa María Ozolotepec y
Santo Domingo Ozolotepec. El clima predominante es frío con lluvias en verano.
Cuenta con una población total de 3,664 habitantes (INEGI 2012), de los cuales 1,861 son mujeres y 1,803 hombres. Existe un total de 776 viviendas. En San Sebastián Río Hondo existe un total de 3 colonias (
ver listado).
Entre algunos de los atractivos turísticos se encuentran:
